Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1lA2A5N3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms