Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm5538W4VSP6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm5538W4VSP6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm5538W4VSP6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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