Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp12aQ9Z1W8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp12aQ9Z1W8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp12aQ9Z1W8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp12aQ9Z1W8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms