Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf11Q9Z1W4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf11Q9Z1W4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms