Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolbQ9WVP6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms