Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms