Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms