Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpc2Q9R244 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms