Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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