Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vstm2bQ9JME9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms