Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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