Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms