Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms