Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms