Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms