Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms