Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmed11Q9D2R4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmed11Q9D2R4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmed11Q9D2R4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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