Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ndc80Q9D0F1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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