Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms