Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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