Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NsmfQ99NF2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms