Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms