Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms