Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms