Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lims1Q99JW4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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