Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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