Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms