Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms