Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Krt79Q8VED5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Krt79Q8VED5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt79Q8VED5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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