Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms