Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r200Q8R281 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms