Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek9Q8K1R7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek9Q8K1R7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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