Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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