Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Atg4aQ8C9S8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Atg4aQ8C9S8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Atg4aQ8C9S8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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