Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYY4

Ttc39b, Tetratricopeptide repeat protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39bQ8BYY4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39bQ8BYY4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms