Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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