Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms