Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Actn1Q7TPR4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Actn1Q7TPR4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms