Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atp8b3Q6UQ17 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atp8b3Q6UQ17 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b3Q6UQ17 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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