Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms