Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbtb40Q6PCS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms