Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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