Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms