Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprcapQ64697 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms