Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TfrcQ62351 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms