Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx3xQ62167 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx3xQ62167 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx3xQ62167 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms