Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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