Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Grik1Q60934 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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