Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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