Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms